Primer Extension

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更新: 2021-05-30
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提供商: 上海吐露港生物科技有限公司
服务名称: 引物延伸实验
规格: 每个基因,每个样本

服务简介

Primer Extension可以用来精确鉴定转录的起始位点;类似的方法还包括S1 mapping,5'-RACE等。相比而言,Primer Extension更直接、也更精确;但是对实验技术的要求也更高。简单来说,就是在靠近转录产物5'端的位置设计一条反向的引物(引物末端标记),然后与总RNA做杂交,并进行逆转录;最后通过测序胶电泳检测逆转录产物。为了精确定位转录起始位点(即逆转录产物的长度),还需要利用这条标记的反向引物进行Sanger法测序,并同样进行测序胶电泳来作为ladder。由于整个过程(包括样本收集、RNA抽提、引物退火杂交、逆转录等)都不能有丝毫的RNA降解,所以对其中每一步的操作要求都非常高,否则得到的结果就有可能不是一个位点(多个位点或者一片)或者是假的位点。此外,不是每个转录产物都能够鉴定出转录起始位点,比如有些转录本的丰度特别低就很可能做不出的。

吐露港目前开发出了荧光标记法结合ABI测序仪来鉴定转录起始位点的方法;希望能够为您的实验带来帮助。

服务流程

样本要求

1. 样本要以最快的速度冻存在液氮、干冰中,然后转移到-80度;干冰运输。

2. 不要用市售的RNA稳定剂保存,然后置于常温。

3. 您可以提供抽提好的RNA,我们收到后会进行质检;如果不过关,则不会进行下一步的Primer Extension实验。

4. 建议在做Primer Extension之前,先做RT-PCR以了解该转录本在该处理条件、该处理时间下的转录情况。

服务收费

 

项目名称 费用(人民币) 周期(工作日)
RNA抽提 1000/样品(非kit抽提,最多3数;含质检费用) 5
质检 300/样品/次 3
Primer Extension 15000/基因/样本(含所有费用,如荧光引物定制等) 20(定制荧光引物耗时长)
数据处理 免费 5
说明:若目的基因的转录丰度非常低,我们通过质检会给客户反馈;若客户坚持做后续的Primer Extension实验,那么无论是否能够做出来阳性结果,我们都将收费;若客户接受我们的建议停止后续的Primer Extension实验,那么我们将仍然收取前面的RNA抽提/质检等费用。


ToloBio技术支持发表的论文

Jie Ren, Yu Sang, Yongcong Tan, Jing Tao, Jinjing Ni, Shuting Liu, Xia Fan, Wei Zhao, Jie Lu, Wenjuan Wu, Yu-Feng Yao (2016)
Acetylation of Lysine 201 Inhibits the DNA-Binding Ability of PhoP to Regulate Salmonella Virulence. PLOS Pathogens . DOI:10.1371/journal.ppat.1005458