电泳迁移率变动分析(electrophoresis mobility shift assay, EMSA)又称凝胶阻滞(迁移)实验(gel retardation assay, gel shift assay)，是一种使用标记探针来研究蛋白与DNA调控区序列结合的技术，可对DNA序列特异性结合蛋白进行定性和定量，是目前检测核转录因子常用的方法。电泳迁移率变动分析检测中，当DNA结合蛋白与相应的DNA 片段或寡核苷酸结合而形成DNA-蛋白质复合物后，DNA片段的分子量及电荷发生改变，因而在非变性聚丙烯酰胺凝胶（native PAGE）电泳体系中，其电泳迁移率发生改变，通常较游离的DNA片段的泳动速率慢得多，因而，在X-光胶片上形成较游离DNA片段滞后的带型。结合滞后条带的有无、 量的多少，可反映出DNA 结合蛋白与DNA探针的结合活性、DNA 结合蛋白的表达及活化水平，并可以计算出DNA结合蛋白与DNA探针的结合常数或解离常数。用此方法可以鉴定某种DNA结合蛋白，以及这种蛋白与特异基因序列的结合能力。
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