iTRAQ同位素标记定量

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更新: 2021-05-25
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提供商: 北京青莲百奥生物科技有限公司
服务名称: iTRAQ同位素标记定量
规格: 6个样本以上
一、iTRAQ技术简介
     iTRAQ技术是由美国应用生物系统公司(Applied Biosystems Incorporation,ABI)2004年开发的同重标签标记的相对和绝对定量(isobaric tags for relative and absolute quantitation,iTRAQ)技术。
     iTRAQ试剂是可与氨基(包括氨基酸N端及赖氨酸侧链氨基)连接的胺标记同重元素。在一级质谱图中,任何一种iTRAQ试剂标记不同样本中的同一蛋白质表现为相同的质荷比。在一级质谱中,不同来源的相同肽段表现为一个峰;在二级质谱中,iTRAQ试剂中的平衡基团发生中性丢失,信号离子表现为不同质荷比(114~121)的峰,因此根据波峰的高度及面积,可以得到同一蛋白在不同样本中的表达差异;同时,肽段的MS/MS结果结合数据库检索可以鉴定出相应的蛋白种类。
 
二、技术原理
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报告部分共有8种:质量数分别为113~119 Da 及 121 Da,因此iTRAQ 最多可同时标记 8 组样品(客户可按需选择标记个数)。
肽反应部分:能与肽链 N 端及赖氨酸侧链发生共价连接,从而将报告部分和平衡部位标记到肽段上,几乎可以标记所有蛋白质。
平衡部分:质量数分别为 31~24 Da,与报告部分相互配合,保证 iTRAQ 试剂标记的不同样本的同一肽段具有相同的质荷比。
 
三、实验流程
 
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iTRAQ实验流程。
  1:收集不同组别的样本并分别提取蛋白质;
  2:蛋白质经过还原,封闭后用胰蛋白酶酶切;
  3:各组样本的肽段混合物分别用不同的iTRAQ试剂标记;
  4:等量混合各样本中的标记肽段;
  5:MS/MS质谱检测及分析。
 
四、技术优势
灵敏度高:可检测出低丰度蛋白;
分离能力强:可分离出酸/碱性蛋白,小于10KD或大于200KD的蛋白、难溶性蛋白等;
适用范围广:可以对任何类型的蛋白质进行鉴定,包括膜蛋白、核蛋白和胞外蛋白等。
高通量:可同时对8个样本进行分析,特别适用于采用多种处理方式或来自多个处理时间的样本的差异蛋白分析;
结果可靠:定性与定量同步进行,同时给出每一个组分的相对表达水平、分子量和丰富的结构信息;
自动化程度高:液质连用,自动化操作,分析速度快,分离效果好。
 
五、信息分析
• 数据产出统计
• 蛋白质鉴定结果
• 蛋白质定量结果
• 蛋白质GO分析
• 蛋白质COG分析
• 蛋白质Pathway代谢通路分析
• 差异蛋白GO富集分析
• 差异蛋白的Pathway富集分析
• 重复性分析(仅针对有重复设计的项目)
• 多样品间表达模式聚类(适用于样本数≥3的项目
也可以根据客户的要求进行个性化定制分析
 
六、样品准备
1.蛋白运输:24小时内可以4度运输;
2.蛋白长期保存:-20℃;
3.待检测蛋白要求:蛋白量最低50ug,浓度最低要 为5ug/ul 10ul,否则同位素无法标记;
4.蛋白提取试剂要求:使用普通的组织、细胞裂解液即可,切忌不要使用二维电泳试剂提取;
5.直接提供组织或细胞。