Pathway crosstalk分析_生物信息学_分子生物学服务_技术服务库_商城

提供商：	湖南科互生物医药有限公司
服务名称：	Pathway crosstalk分析

服务项目分析内容

富集分析是对基因功能及其表达进行分析的一种方式。通过富集分析，能够对基因的功能有更进一步的了解

通路富集分析：目前，KEGG是有关Pathway的主要公共数据库。根据挑选出的差异基因，计算这些差异基因同Pathway 的超几何分布关系，Pathway 分析会对每个有差异基因存在的pathway 返回一个p-value，小的p 值表示差异基因在该pathway 中出现了富集，并计算误判率。Pathway 分析对实验结果有提示的作用，通过差异基因的Pathway 分析，可以得到与主流表达趋势相关的所有基因参与的显著、靶向的Pathway，寻找不同样品的差异基因可能和哪些细胞通路的改变有关，同时将上下调的差异基因映射到每一个pathway map上，定位关键通路的关键基因。

GO富集分析：Gene Ontology可分为分子功能（Molecular Function），生物过程（biological process）和细胞组成（cellular component）三个部分。蛋白质或者基因可以通过ID对应或者序列注释的方法找到与之对应的GO号，而GO号可对于到Term，即功能类别或者细胞定位。通过富集分析可以找出在统计上显著富集的GO Term。该功能或者定位有可能与研究的目前有关。通过GO分析能够更近一步了解基因的潜在功能。

Pathway crosstalk分析：Pathway 分析对实验结果有提示的作用，通过差异基因的Pathway 分析，可以找到富集差异基因的Pathway 条目，寻找不同样品的差异基因可能和哪些细胞通路的改变有关。而不同的pathway之间可能存在互相的影响。该分析能够找出不同通路之间的潜在相互作用，为更加深入的了解基因功能及pathway的作用提供基础。并且可以进行Network构建，帮助用户快速定位基因的功能和其参与的信号通路，并进行清晰直观的展示。

个性化服务：我们可以对客户提出需求进行有针对性的服务。可以对测序数据集的差异基因，蛋白进行上述分析，并构建相关network网络图。此外，也能针对性的对RNA数据进行分析，对RNA的潜在靶标基因进行相关富集分析，从而进一步了解RNA功能。

技术展示

文献：《GOMA: functional enrichment analysis tool based on GO modules》
期刊：《Chinese Journal of Cancer》
IF值：4.111

文献：《An integrated analysis based on transcriptome and proteome reveals deastringency-related genes in CPCNA persimmon.》
期刊：《Scientific Reports》
IF值：4.259