货号: | F1002 |
PNA 的主要应用
序列特异性的PCR抑制剂( PNA 夹)
端粒、着丝粒 FISH 探针,基因特异性探针,感染试验反义/抗微生物试剂
miRNA 抑制剂
双链 DNA 侵入和捕获
微阵列探针
非标记 PNA
由于其高亲和力和特异性,PNA 能有效结合靶核酸。未标记的PNA通常作为基因的PCR反应的特异性阻断剂(PNA 夹)。这种技术可以有效地检测靶基因中的SNP突变。
PNA 倾向于定向且逆平行结合到靶核酸。PNA 5' 端的氨基(也写为 5' 或 H-),可以结合其它功能基团,PNA 3' 端的酰胺基(也写为-NH2或3‘)反应活性弱。5' 端乙酰化可以阻止其继续发生反应。
因为 PNA 的解链温度 Tm 高于DNA,一般情况下,大部分使用的PNA的长度为10 ~ 21个碱基。PNA 链越长,溶解性越差。嘌呤含量高(>60%)尤其是碱基G,是导致溶解性差的原因。根据序列,PNA 链最大长度约为 40 个碱基。然而,我们强烈建议检查Tm,设计探针应具有适当的长度和序列。
当 PNA 链较长(>22mer)或者嘌呤含量高(>60%) 时,为了提高 PNA 探针的溶解性,我们建议在序列中加入一些助溶基团如 O linker、E linker、X linker 或者两个赖氨酸。当 PNA 偶联多肽或染料时,接头(linker) 可以起到空间间隔(spacer)的作用。
可能用到的接头
- O linker(也称 AEEA 或 eg1):常用来提高溶解性- 起到空间间隔作用:O、E、X、C3、C4、C6、C12
- 加入巯基:C6SH、C11SH
标记 PNA
PNA 链 5' 端和 3' 端均可以标记。由于 3' 端是非活性基团(-CONH2),所以需加入一个赖氨酸,其侧链上的氨基可以用来标记。
如果在 5' 端标记,我们建议在 PNA 和标记物之间加 1~2 O linkers.
标记物:荧光基团(—NHS 酯或羧基酰胺)、生物素、棕榈酸、C41H64O14、DABCYL、叠氮化物、亚甲基蓝、巯基等。
温馨提示:不可用于临床治疗。