长链非编码(InRNA)研究

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更新: 2021-05-26
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提供商: 世宸生物
服务名称: 长链非编码(InRNA)研究
 长链非编码RNA(Long noncoding RNA,IncRNA)指的是长度超过200nt的RNA分子。它们不编码蛋白,位于细胞核或胞质内,具有保守的二级结构,可与蛋白质、DNA和RNA相互作用,通过多种机制(如基因印记、染色质重塑、细胞周期调控、剪接调控、mRNA降解和翻译调控等)在多种层面上(如表观遗传学、转录调控及转录后调控等)调控基因的表达水平。
IncRNA参与多种生物学过程的调控,在多种生命活动中发挥重要作用,该领域的关注度也日益增高,已成为继信使RNA(mRNA) 、小RNA(microRNA、 siRNA等)之后功能基因组学最火热的研究领域。
 
世宸现提供下述IncRNA  研究服务
确定IncRNA表达
利用RT-PCR或者q RT-PCR 或者IncRNA在不同组织中的表达水平。
‚探究IncRNA 特点
●通过QD-FISH原位杂交技术定位;或者通过细胞核质分离试剂盒得到RNA,QRT-PCR检测其分布;
●全长序列试验方法:通过RACE得到IncRNA完整的全长序列。
ƒIncRNA的功能研究
IncRNA较长,承载的信息量多,更容易形成高级结构,其功能具有多样化和特异性强的特点。类似于miRNA,探讨IncRNA功能可用gain/loss lf function策略,过表达或沉默IncRNA后观察表型。即研究IncRNA功能获得后或者功能缺失后对细胞增殖、凋亡、侵袭、转移与克隆形成,以及病毒的转录复制等的影响。
功能获得性研究
构建IncRNA过表达质粒或者慢病毒、腺病毒包装载体。
●功能缺失性研究
SiRNA, shRNA、反应核酸。
④检测结合蛋白质
利用体外转录,RNA pull down,MS等技术手段检测与RNA绑定的蛋白质。
⑤预测并验证作用的mi RNA
利用软件预测mi RNA在IncRNA的作用靶点,并进行验证。
⑥表达调控
将IncRNA表达与其它领域相结合,解释其调控机理。
●DNA甲基化和乙酰化;可通过检测相应基因甲基化、乙酰化差异与IncRNA结合分析。
●转录因子:研究IncRNA与转录因子的调控


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