Charm-Pure 精纯大量唾液gDNA提纯试剂盒

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更新: 2020-09-15
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 Charm-Pure™ 精纯大量唾液 DNA 提纯试剂盒

室温运输和保存,Proteinase K 和 RNase A 保存在 4 ºC。

试剂盒组成及贮存

Charm-Pure™ 精纯大量唾液DNA提纯试剂盒可从 4 ML 唾液中提纯高质量的gDNA,其组成如下表,除了 Proteinase K 和 RNase A 需要保存在 4 ºC 之外,其余组分室温保存即可。可进行 50或者250 次唾液gDNA 的提 纯。

产品介绍:

Charm-Pure ™ 精纯大量唾液 DNA 提纯试剂盒专为从 4 ML 新鲜唾液、冻存唾液、Charm-Protect™ 或其他公司 唾液保存液中分离提纯高质量的唾液 gDNA 而设计,操作步骤简单迅速。昌美生物将固体表面可逆结合技术 (SSRB)和传统的核酸硅膜技术相结合,采用特别的结合管和改进的硅膜来选择性地吸附核酸,能有效处理 4 ml 的唾液混合液,高效率地提纯回收高纯度的唾液 gDNA。产量高,质量好!提纯的 gDNA 可直接用于下游各种实 验,如限制性酶切反应、SNP、序列分析、DNA 建库,NGS、全基因组扩增(WGA)和 DNA 甲基化分析等。

亮点:

操作简单:可处理 4 ml 唾液样品,避免多次处理小量样品,操作步骤简单,不需要特别的仪器。 质量可靠,回收率高:采用独特的固体表面可逆结合技术和改进的硅膜核酸结合技术,能最大程度的回收唾液样品 的 gDNA 。质量高,重复性好。

所需的额外材料

 无水乙醇、异丙醇

 1.5 ml 或 2.0 ml 离心管,15 ml 的的可离心管。涡旋振荡器、温箱,水浴锅或恒温金属浴。

 可离 1.5 ml 或 2.0 ml 离心管的离心机和可离心 15 ml 管的摇摆式离心机.

常规防范

 该试剂盒仅用于实验。

 实验操作时需穿实验服,戴一次性手套。避免摄取和吸入试剂,避免与试剂盒中试剂进行直接接触,一旦接 触,用水彻底冲洗。

 提纯核酸时,使用无菌新吸头避免污染。

实验前准备

1、 在进行从唾液提纯 gDNA 之前,需要根据提纯的样品数目制备新鲜的 Binding Buffer(KB6)工作液: 将 Binding Buffer(KB6)与异丙醇以 1:4 体积比混匀,如配制 500 µl Binding Buffer(KB6)工作液需 将 100 µl Binding Buffer(KB6)与 400 µl 异丙醇混合均匀得到。需要制备 Binding Buffer(KB6)工作 液的体积根据: (1)待提纯的样品数目;(2)预期的损失,在悬浮过程中,一般会有 10%的损失。每 100 µl 细胞裂解液需加 100 µl 含异丙醇的 Binding Buffer(KB6)工作液(1:1 体积比)。剩余的 Binding Buffer(KB6)工作液当天予 以丢弃。

2、 制备 Washing Buffer I(WB1)工作液:如果是 JM-279-M 试剂盒,加 22 ml 无水乙醇到 Washing Buffer I (WB1)中,充分混匀。如果是 JM-279-L 试剂盒,加 110 ml 无水乙醇到 Washing Buffer I(WB1)中,充分混 匀。在瓶上做好标记表示已加乙醇!室温保存,加乙醇的 WB1 在六个月之内使用。

3、制备 Washing Buffer II(WB2)工作液:如果是 JM-279-M 试剂盒,加 44 ml 无水乙醇到 Washing Buffer II (WB2)中,充分混匀。如果是 JM-279-L 试剂盒,加 220 ml 无水乙醇到 Washing Buffer II(WB2)中,充分 混匀。在瓶上做好标记表示已加乙醇!室温保存,加乙醇的 WB2 在六个月之内使用。

4、该试剂盒该可从 4 ml 唾液保存液中提纯 gDNA(2 ml 唾液 + 2 ml 唾液保存液)或冻存的唾液。在收集唾液时 候,为了避免 gDNA 降解,请遵守标准的 Charm-Protect™ 唾液 DNA 保存液收集和保存程序收集唾液。

操作指南

制备唾液细胞裂解液

1. 取 80 µl RNase A(RA2)到一个 15 ml 离心小管中。

2. 将储存在 Charm-Protect 唾液收集瓶中的唾液样品与唾液保存液颠倒 7-8 次后静置 3-5 分钟,让颗粒杂物沉 淀到瓶底。

3. 从唾液收集瓶中吸取 4 ml 唾液与保存液的混合物到预先加了 RNase A(RA2)的 15 ml 离心管中,将离心 管盖子盖上后颠倒 7-8 次,混合均匀。当吸取唾液混合物时,注意不要吸到收集瓶底颗粒状沉淀杂物。

4. 向管中加 80 µl Proteinase K(PK2),将离心管盖紧后颠倒离心管 15-18 次,充分和唾液混合均匀。

5. 将离心管置于 62 ºC ,温箱或者水浴锅或金属浴中温育 45 分钟,进行裂解,期间颠倒混合离心管,如有需 要,也可将样品在 52 ºC 温育过夜。(注意不是 62 ºC 过夜)。

6. 将离心管在转速 ≥ 2,250 x g 的摇摆式离心机里室温离心 10 分钟来去除颗粒物质,如食物颗粒、未经消化 的死细胞和纤维碎片。

Charm-Protect ™ 唾液保存液保存的唾液操作步骤 

如果您的样本是新鲜唾液、冰冻的唾液,或者是使用其他公司的唾液保存液保存的唾液,请使用以下步骤制备唾液 细胞裂解液:

1. 取 80 µl RNase A(RA2)到一个 15 ml 离心小管中。

2. 向管中加入 400 µl Lysis Buffer (PKLB)(PKLB 和唾液样品的体积比例是 1: 9)。

3. 将唾液样品颠倒 7-8 次后静置 3-5 分钟,让颗粒杂物沉淀。

4. 从样本中吸取 3600 µl 唾液或者唾液混合物,加到预先加了 RNase A(RA2)和 PKLB 的 15 ml 离心管中, 将 离心管盖子盖上后颠倒 9-10 次,混合均匀。(当吸取唾液时,注意不要吸到底部颗粒状沉淀杂物。)

5. 向管中加 80 µl Proteinase K(PK2),将离心管盖紧后颠倒离心管 15-18 次,充分和唾液混合均匀。

6. 将离心管置于 62 ºC 温箱,水浴锅或金属浴中温育 60 分钟,进行裂解,期间颠倒混合离心管,如有需要, 也可将样品放在 52ºC 温育过夜 (注意不是 62 ºC 过夜)。

7. 将离心管在转速 ≥ 2,250 x g 的摇摆式离心机里室温离心 10 分钟来去除颗粒物质,如食物颗粒、未经消化 的死细胞和纤维碎片。

结合 DNA 产物

1. 转移 3900 µl 澄清的唾液裂解液到一个 10 ml 结合管(BT4)中,注意不要吸到离心管底的碎片沉淀。

2. 加 3900 µl 含有异丙醇的 Binding Buffer(KB6)工作液到结合管(BT4)中,将结合管(BT4)盖紧后颠倒结 合管 15-18 次,充分混合均匀(注意:溶液充分混合非常重要)。

3. 将结合管(BT4)在转速 ≥ 2,250 x g 的摇摆式离心机室里温离心 10 分钟来结合 DNA 到管壁。

4. 直接将结合管中的液体倾倒入废液收集杯中,然后将结合管倒放在干净的吸水纸上面 3 至 8 分钟,使管内 液体尽量去掉。

5. 加 1200 µl Elution Buffer(EB2)溶液到离心小管,涡旋 1 分钟,62 ºC 温育 15 -20 分钟,再涡旋 1 分钟,使 沉淀完全溶解。

6. 加 720 µl Binding Buffer(GB5)到结合管内,将结合管(BT4)盖紧后颠倒结合管 7 - 8 次,混合均匀。

7. 向上述混合物中加 720 µl 乙醇,将管盖紧后颠倒结合管 15-18 次,充分混合均匀。(总体积是 2640 µl)

8. 将 660 µl 上述制备的混合物转移到配有收集管(Collection Tube)的离心柱(Spin-Column)中,共转移 2 次,分别到 2 套离心柱。室温下 8000 rpm(RCF = 5800 g)离心 1 分钟,让所有液体通过离心柱。

9. 取出 Spin-Column,将收集管中的滤液丢弃,将 Spin-Column 重新插回到收集管中。

10. 重复上述 8 和 9 步骤, 将全部溶液都通过 2 个离心柱。

清洗 DNA 产物

1. 向离心柱(Spin-Column)中加 500 µl 含有乙醇的 Wash Buffer I(WB1)。

2. 将带有收集管的离心柱(Spin-Column)以最大转速(≥13000 rpm 或 16000 g)室温离心 1 分钟,倒掉收集管 中滤液。

3. 向 Spin-Column 中加 500 µl 含有乙醇的 Wash Buffer II(WB2)。

4. 将 Spin-Column 以最大转速(≥13000 rpm 或 16000 g)室温离心 1 分钟,倒掉收集管中滤液。

5. 重复步骤 3 和 4,即用 Wash Buffer II(WB2)洗两次。

6. 以最大转速将带有收集管的 Spin-Column 离心 1 分钟来彻底去除含有乙醇的 WB2。丢掉收集管。将 SpinColumn 放入一个干净的 1.5 ml 离心管中。(在转移 Spin-Column 时,注意避免残留的 Wash buffer 接触到 Spin-Column 的尖端。)

gDNA 的洗脱

1. 根据需要洗脱的样品数量,取一定体积的 Elution Buffer(EB2)到 一个 1.5 ml 离心管中,置于 62 ºC 金属 浴 或水浴中加热。

2. 向 Spin-Column 的膜中央,加 150 µl 预热的 Elution Buffer(EB2),将带有离心小管的小柱置于 62 ºC 金属 浴温育至少 5 分钟。

3. 室温下最大速度离心 1 分钟,小柱下 1.5 ml 离心管中的滤液即为纯化的 gDNA。注意:如果有需要,可另 加 100 µl Elution Buffer(EB2)进行再次洗脱。这一步可增加产量 15 - 30 %,但提纯的 gDNA 因为体积增 大,终 浓度会降低。

4. 将来源于同一唾液样本洗脱的 DNA 样本合并。洗脱到离心管中的 gDNA 可直接用于各种下游反应,或者置 于 4 ºC 短期保存或 - 20 ºC 长期保存。