• 游客
收藏 | 举报 2018-01-22 11:00   关注:215   回答:33

【旧帖整理】miRNA、siRNA、RNA干扰原理,步骤及相...

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【旧帖整理】miRNA、siRNA、RNA干扰原理,步骤及相关问题总结!有问题的也可以提,共同交流讨论![精华]

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  • 游客
举报 2018-01-26 12:10
4. siRNA表达载体

多数的siRNA表达载体依赖三种RNA聚合酶III 启动子(pol III)中的一种,操纵一段小的发夹RNA(short hairpin RNA, shRNA)在哺乳动物细胞中的表达。这三类启动子包括大家熟悉的人源和鼠源的U6启动子和人H1启动子。之所以采用RNA pol III启动子是由于它可以在哺乳动物细胞中表达更多的小分子RNA,而且它是通过添加一串(3到6个)U来终止转录的。要使用这类载体,需要订购2段编码短发夹RNA序列的DNA单链,退火,克隆到相应载体的pol III 启动子下游。由于涉及到克隆,这个过程需要几周甚至数月的时间,同时也需要经过测序以保证克隆的序列是正确的。
siRNA表达载体的优点在于可以进行较长期研究——带有抗生素标记的载体可以在细胞中持续抑制靶基因的表达,持续数星期甚至更久。
病毒载体也可用于siRNA表达,其优势在于可以直接高效率感染细胞进行基因沉默的研究,避免由于质粒转染效率低而带来的种种不便,而且转染效果更加稳定。
最适用于:已知一个有效的siRNA序列,需要维持较长时间的基因沉默。
不适用于:筛选siRNA序列(其实主要是指需要多个克隆和测序等较为费时、繁琐的工作)。
  • 游客
举报 2018-01-29 01:01
谢谢楼主
  • 游客
举报 2018-01-28 11:08
补充点!

首先外源性或细胞内源性的dsRNA与胞内的RNAi核酸酶(如Dicer)相结合,之后dsRNA被RNAi核酸酶切割成21~23nt的小干扰RNA ( small interference RNA, siRNA) ,此siRNA含有2 ~3nt的3′突出端,被输送到RISC (RNA-in-duced silencing protein complex) , siRNA 作为引导序列引导RISC与同源性的mRNA结合,解旋酶催化mRNA与siRNA的正义RNA链相互交换, siRNA的反义链与同源mRNA结合后,核酸酶在mRNA与siRNA反义链所形成的双链区的5′起始端下游7~10个核苷酸处(也就是双链区的靠近中间位置)切断mRNA,降解的mRNA被释放后, siRNA双链重
新形成,可以继续降解同源的mRNA
  • 游客
举报 2018-01-29 01:17
希望有做这方面的战友,多多发表心得!
  • 游客
举报 2018-01-30 03:07
有没有人用病毒做载体进行RNAi的呢?我现在是菜鸟,有很多问题想请教大家。
  • 游客
举报 2018-01-27 20:48
4. siRNA表达载体

多数的siRNA表达载体依赖三种RNA聚合酶III 启动子(pol III)中的一种,操纵一段小的发夹RNA(short hairpin RNA, shRNA)在哺乳动物细胞中的表达。这三类启动子包括大家熟悉的人源和鼠源的U6启动子和人H1启动子。之所以采用RNA pol III启动子是由于它可以在哺乳动物细胞中表达更多的小分子RNA,而且它是通过添加一串(3到6个)U来终止转录的。要使用这类载体,需要订购2段编码短发夹RNA序列的DNA单链,退火,克隆到相应载体的pol III 启动子下游。由于涉及到克隆,这个过程需要几周甚至数月的时间,同时也需要经过测序以保证克隆的序列是正确的。
siRNA表达载体的优点在于可以进行较长期研究——带有抗生素标记的载体可以在细胞中持续抑制靶基因的表达,持续数星期甚至更久。
病毒载体也可用于siRNA表达,其优势在于可以直接高效率感染细胞进行基因沉默的研究,避免由于质粒转染效率低而带来的种种不便,而且转染效果更加稳定。
最适用于:已知一个有效的siRNA序列,需要维持较长时间的基因沉默。
不适用于:筛选siRNA序列(其实主要是指需要多个克隆和测序等较为费时、繁琐的工作)。
  • 游客
举报 2018-01-29 04:37
想请教一个问题,VIGS毕竟是利用病毒来做载体的,我是做观赏植物RNAi的,这样不会对植物产生很大的影响吗?就算试验最后成功了,我育出的品种也没什么价值呀,因为它本身就是带病毒的,没法推广。
  • 游客
举报 2018-01-31 10:44
有时间认真学习一下,呵呵
  • 游客
举报 2018-01-28 12:18
受益良多!
  • 游客
举报 2018-01-24 01:58
喜欢,谢谢了
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